レッドクイーン仮説（Red Queen Hypothesis）は、進化生物学の理論の一つで、種が生存し続けるためには、環境の変化や捕食者、病原体、競争相手などの進化に対抗して、絶えず進化し続けなければならないという考え方です。この仮説の名前は、ルイス・キャロルの『鏡の国のアリス』に登場するレッドクイーンに由来しています。彼女はアリスに対し、「この国では、どこにも行けないために全力を尽くさなければならないのよ」と語ります。この言葉から、生物が生存し続けるためには絶えず努力（進化）しなければならないという概念が生まれました。
レッドクイーン仮説は、特に寄生虫とその宿主の関係で顕著に見られます。宿主が寄生虫に対する防御機構を進化させると、寄生虫もそれに対抗するために進化し、このような相互作用が進化の「武装競走」となります。この過程は、種が絶えず進化し続けることを促し、生態系内での相互関係のダイナミクスを維持する上で重要な役割を果たします。
レッドクイーン仮説は、なぜ生物が絶えず進化し続けるのか、なぜ多様性が保たれるのか、といった進化の基本的な疑問に答えるための枠組みを提供します。同時に、進化の過程が静的なものではなく、生物とその環境との間の絶え間ない相互作用によって推進されるダイナミックなプロセスであることを示しています。
